公司存在以下情况不能直接注销
 1、公司有分支机构。如果想注销母公司，那么需要先把子公司或分公司注销掉，否则母公司是无法注销的。
2、公司存在未完结的诉讼。若当公司存在未完结的诉讼，只有公司诉讼事项执行完毕后，工商才会受理该公司的注销。
3、公司名下有资产。公司资产分为有形资产（固定资产与流动资产）和无形资产。公司申请注销，资产必须妥善处理。资产没有处理或处理不当，不仅企业会有损失，而且影响注销。
4、证照不齐全。如果公司的营业执照或公司章丢失，会影响注销的进度，需先补齐相关证照，才可以注销。

注销流程复杂繁琐耗时长
公司注销的一般流程是：清算组备案——国家企业信用系统公示——注销税务——注销营业执照——注销银行账户——注销所有印章。
公司注销，需要国税局、地税局、工商局、银行之间来回跑。不懂流程的话来回跑的次数和浪费的时间会更多。如果资料准备不全或者有误，需要重新准备......一般来说，公司注销整个流程需要3个月左右，如果公司存在一些严重问题，比如，企业有罚款，或进入黑名单等，有可能需要一年半载才能注销

税务注销难

整个注销环节中，税务问题是最难处理的，倘若有问题，不仅需要补齐税务，还有罚款和滞纳金产生。 
1、无法提供凭证、账本等
注销公司时，税局可能会查账，需要提供近三年的记账凭证、财务报表，如果公司长久以来没有做账、报税或是中断记账的话，那就得先补账。大部分公司都是因为这类的原因而导致无法注销。
2、公司被列入非正常户
公司因为没有记账报税、逾期申报等原因被列入非正常户，遇上这种情况，需要先把公司的异常情况解决掉，才能注销。需要补税，并且交罚款和滞纳金（罚款金额以税局核查为准）。
3、公司存在债务问题
公司有尚未缴纳完毕的税款、社保欠费、甚至是罚款，税务也是无法注销的！企业只有在缴纳完税费、社保还有罚款，才能继续办理注销手续。