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其实深圳公司注销不通过的原因主要有以下4中情况：
1、深圳公司有分支机构或子公司没有注销；
一般做的大一些的企业通常都会设立自己的子公司。当公司业务上面出现问题的时候，要是想注销母公司，就必须先将公司的分支机构和分公司注销掉，否则母公司是无法注销的。
2、公司税务异常；
按照相关的规定，深圳公司从成立起到公司注销，这个期间都是需要按时记账报税，申报年报的，要是公司长时间没有做账报税的话，想申请注销公司的话，首先要先将公司的税务恢复到正常状态下才可以注销公司，很多企业在申请注销公司的时候这个问题都会碰到，所以大家一定要注意了。
3、提供注销证件资料不齐全；
要是公司所提供的注销证件和资料不齐全的话是无法申请注销成功的，公司证件及资料是申请注销的必要硬条件。
4、公司非正常户；
我们在申请注销公司之前，首先注销公司税务登记，那要是公司被税务局列入为非正常户之后，我们就得先解决税务异常的问题，不能直接申请注销。一般被列入非正常户主要的原因还是公司不经营了，放置在那里，不管也不报税导致的。